El Dr. Carlos Wong, ha recibido múltiples galardones entre los cuales cabe destacar:

• Premio Internacional Reina Sofía, otorgada por la Reina de España
• Premio Panamericano Carl Kupfer otorgado por la Asociación Panamericana de Oftalmólogía (PAAO)
• Medalla al mérito del Colegio Médico del Perú
• Medalla del Congreso de la República
• Doctor Honoris Causa otorgado por tres universidades
• Mención en Top People of Perú como uno de las 3,000 personas más importantes
• Medalla del Parlamento Andino